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合成生物学CRO融资2800万美元,让“一键”基因合成成为现实

2023-06-22 09:55:07 来源:动脉新医药
近日,合成生物学解决方案提供商Telesis Bio获得2800万美元的优先股初始预付资金。该私募还包括发行股权认证,如果现金行使,将为Telesis Bio提供另外4620万美元的收益。
本轮融资由Novalis LifeSciences LLC领投,Northpond Ventures、BroadOak Capital Partners和M-185 Corporation参与。
Telesis Bio致力于为科学家创造新颖的合成生物学解决方案,目前已推出商业化自动台式基因合成平台BioXp。这是一个能够在几小时至几天内合成DNA和RNA的台式自动化仪器,可满足合成生物学发现和临床前开发需求。
Telesis Bio(曾用名Codex DNA)2021年在纳斯达克全球市场上市。截至6月16日,Telesis Bio市值为6062.10万美元。此前3月,Telesis Bio发布了两个新型试剂盒,实现了对于BioXp平台适用方向的扩增。这使其股价上涨了10%。

来自Gibson技术之父

合成生物学CRO


【资料图】

目前,DNA合成主要依赖传统的化学合成法,其合成长度及成本存在难以逾越的极限,无法满足生物制造领域日益增长的需求。制备过程中使用和产生的有毒化学物质也带来了一定危害。
酶促DNA合成(EDS)因其在合成速度、长度、效率及成本等方面拥有化学合成无法比拟的潜力,因而成为DNA合成技术发展的前沿。Telesis Bio的核心合成方法即为Daniel Gibson联合发明的Gibson Assembly方法。
Gibson Assembly方法是一种无缝组装的酶切连接方法,能够简单、快速、高效实现DNA定向无缝克隆,最多可一步完成6个片段的连接。这一方法是目前最常使用的酶切克隆方案之一,也是分子克隆的“金标准”。

▲ Daniel Gibson博士

图源:Telesis Bio

2004年,Daniel Gibson博士成为基因组学研究组织JCVI的合成生物学组教授,参与制造全球首个合成细菌细胞——丝状支原体JCVI-syn1.0(Mycoplasma mycoides),开发了Gibson Assembly方法。同时他还在Synthetic Genomics担任多项职务,2018年进入Telesis Bio担任首席技术官。
2019年,美国合成生物学公司Synthetic Genomics旗下的子公司SGI-DNA正式宣布独立运营,随后更名为Codex,即今天的Telesis Bio。
母公司Synthetic Genomics由合成生物学研究先驱、基因组学研究先驱J. Craig Venter博士创立。J. Craig Venter博士是JCVI和Human Longevity的莱讷河创始人和执行总裁。Human Longevity曾是世界上最大的人类基因测序公司,拥有全世界最完整的生物信息数据库。

全自动台式机器,

一键实现基因合成

BioXp平台集成了DNA和mRNA合成的全流程。依托这台全自动化、高通量的台式机,只需要点击按钮,即可实现快速、自动合成生物序列。
▲图源:Telesis Bio官网
这一全自动合成的平台能力依托于Telesis Bio的科学创新:
1、创新的运动控制
2、流体处理
3、甲板上热循环功能
4、Gibson Assembly方法

▲ BioXp平台样机

图源:Telesis Bio官网

相比传统的单个DNA和RNA制备方法,BioXp平台利用自动化的可靠性和易用性,优化资源利用率,加速候选序列制备。因此,科学家能够克服因获取DNA和mRNA的复杂性限制,扩大合成生物学发现,加快产品开发周期的设计—构建—测试过程。
目前,BioXp平台已更新至第三代产品,即BioXp9600。相比上一代产品,BioXp9600旨在加速高吞吐量筛选和发现工作流程,使平台可在一夜之间无缝合成和克隆97个候选基因
基于新一代机器BioXp9600,Telesis Bio提出了一个高通量、完整、自动化的解决方案,即附加BioXp试剂套件,适用于特定的合成生物学工作流程制作。在这一延伸的解决方案中,使用者将能够一键自动合成mRNA、克隆扩增DNA、构建变体库等。
随着BioXp平台套件升级,Daniel Gibson方法也更新为Gibson Assembly RapidAMP方法。这一方法允许无细胞合成和扩增转基因合成DNA,并允许在一次运行中生成多达24种不同的DNA结构。

▲ 资料:Telesis Bio

制图:动脉新医药

目前,适应不同赛道的套件试剂盒正在陆续上市,成为BioXp平台的强势补充。其NGS库套件5月完成首次商业发货、DNA克隆试剂盒5月完成首次商业装运。

优化多项基因组解决方案,

加速合成生物学产品开发

搭载试剂套件的BioXp9600实现了一键自动制备、全流程自动化的合成生物学工作。这一自动化被用于合成生物学的许多领域,包括新型传染病疫苗、抗体治疗与免疫疗法、工程肉类替代品、可持续细胞农产品等的研发之中。
◆ 基因组编辑——加速制造全基因序列的DNA分子
BioXp平台可以在几天至几周的时间内实现大型结构和全长基因组的构建、编辑。同时,BioXp平台的使用可以修改曾经无法编辑的工程师基因组和疫苗支架、设计缺乏致病性的全合成基因组、快速实现新兴菌株的研究和开发。
◆ 精密医学——加速识别验证个性化新抗原
作为主要的肿瘤排斥抗原,新抗原允许肿瘤激活免疫平台并能够诱导有效的抗肿瘤反应。随着癌症治疗个性化药物增加、单个患者新抗原开发受到关注。在识别和验证新抗原过程中,速度是其中重要一环。
BioXp的按需、高通量基因和mRNA合成、克隆可以快速筛选和开发个性化的癌症治疗。Gibson Assembly RapidAMP技术在克隆和扩增过程中避免使用大肠杆菌,从而消除了内毒素污染和免疫原性。
◆ 疫苗开发——加速合成mRNA疫苗开发
BioXp平台可快速合成的Denovo基因可以增加抗原蛋白的特异性、制作更有效的疫苗佐剂和更安全的特化载体。同时,BioXp平台的密码子优化和突变库可以加快疫苗开发速度,并提高重组基因、佐剂和载体的效率和安全性。此外,抗原表位映射技术和BioXp平台的快速迭代能力,可以加快疫苗开发的合理设计策略。
◆ 抗体开发——加速筛选和优化以推进抗体发现
BioXp平台可实现一天内的高通量DNA合成,简化抗体候选者的筛选和优化工作流程。使用BioXp平台,研究者可以实现一键合成可变区、克隆至表达向量,并将生成质粒自动放大至转染规模。通过申请,Telesis Bio将提供一个自动化BioXp合成生物学解决方案和操作白皮书。在现实案例中,抗体候选合成时间减少了66%。抗体发现在6周内完成。
◆ 免疫疗法——加速免疫监测和新CAR设计
针对接受癌症免疫治疗以及新型免疫调节疗法的患者,免疫检测的速度和效率决定了治疗方案的调整。BioXp平台的高通量基因合成和灵活克隆能够快速筛选和设计新的CAR、工程TCR、人工转录因子,从而提高肿瘤特异性。这可以支持开发新的基因回路或CAR,通过改变工程T细胞活性或降低免疫抑制线索提高疗效。
◆ 治疗学——快速实现mRNA载体的设计验证
BioXp平台可用于快速产生小规模、生物活性的mRNA,以识别治疗候选的mRNA。在药物发现和开发期间,广泛的按需、自动库合成菜单能够进一步加速设计-构建-测试周期的迭代。当BioXp库套件与mRNA生产结合使用时,筛选和优化时间可以缩短数周或数月。
◆ 代谢工程和酶工程——加速多样性库生成和持续迭代
代谢工程涉及重建和优化模型生物的生物合成途径,能够创建强大的细胞工厂,为各种应用实现蛋白质、酶、代谢物和生物分子的高效生物生产。使用BioXp平台重组新的基因、基因电路来改变构成部分宿主通路,可以精确有效地生产有价值的生物分子,用于生物医学、工业和研究领域应用。
例如,通过BioXp平台合成DNA和mRNA、从预测序列中生成蛋白质,可以帮助更快测试未经检验的蛋白质或酶功能,加速DBTL周期。通过测试催化位点变化的不同组合,蛋白质或酶的功能界限将有可能被突破,以快速推出有价值、低成本的产品。

▲ 代谢工程和酶工程的DBTL流程

图源:Telesis Bio官网

BioXp平台与denovo模块化库设计改造了传统供应链、消除了繁琐的验证,实现了高多样性和低多样性库的快速生成。采用BioXp平台,目标库还能够自动识别序列是否有效,进行持续迭代,助于发现活性高于原始酶的酶。

下一代酶促DNA

合成技术:SOLA

Daniel Gibson并没有停下研发的脚步。沿着Gibson Assembly酶切方法,Telesis Bio创新团队开发出新一代EDS方法,称为SOLA(short oligonucleotide ligation assembly)。
SOLA方法能够从数字DNA序列开始,快速、高保真组装DNA寡核苷酸。目前SOLA方法可制备高达100 bp的寡核苷酸,并应用于生产PCR引物、诊断探针、测序浓缩探针和CRISPR-Cas9引导RNA。此外,100 bp产品可以在BioXp平台上快速组装,以产生合成基因、基因组、mRNA和蛋白质,从而实现全自动的数字到生物转换。相比TdT法和化学合成法,SOLA EDA更快、更准确、吞吐量更高
1、一旦数字输入所需的DNA序列,软件会确定需要哪些构建块,进而自动完成寡核苷酸生成,可制作任何DNA序列。
2、100-mer寡核苷酸可以使用Gibson Assembly在任何基因组中构建任何基因。
3、寡核苷酸的制备只涉及2个步骤的3次循环,形成100个碱基的序列。相比之下,使用单个碱基制备的传统方法需要4个步骤的100次循环。
4、平台搭载的DNA构建块可以反复使用数十万次,DNA合成成本呈指数级下降。
5、SOLA方法没有传统寡核苷酸合成过程中使用和产生的化学废物
6、使用短DNA构建块合成寡核苷酸的技术提供了更高的耦合效率,即产生了具有更高序列精度和全长产物百分比,有可能优化下游应用(CRISPR、NGS)的准确性。
SOLA酶促DNA合成技术将集成于Telesis Bio的下一代Oligo打印机和数字生物转换器仪器中。

辉瑞合作加速盈利,

技术红利后产品拉动收入增长

Telesis Bio初上市时,“首个合成生物学台式机器”的技术红利为其带来了高涨的股价。
▲ 图源:Google Finance
但单一产品管线带来的可持续性有限,难以获得长期的关注和资金支持。另外,作为基因编辑和基因疗法的CRO供应商,Telesis Bio的市场相对有限,股价表现一般。
目前,其平台产品正迎来商业化上升期、适应不同研发方向的试剂盒陆续推出,后生增长动力强劲。
广阔市场的净增有限,而Telesis Bio在mRNA赛道市场却颇受青睐。2021年12月,Codex DNA宣布与辉瑞达成合作,将其技术应用于mRNA疫苗和其他疗法的开发。
2022年底,Telesis Bio实现了与辉瑞合作与许可协议的第一个里程碑,进一步开发新型EDS技术SOLA,供应辉瑞用于mRNA疫苗和生物疗法的研发。这一里程碑也为Telesis Bio带来250万美元的收入。
2022年第四季度,Telesis Bio出售收入达到创纪录的950万美元,同比增长208%,其中BioXp平台销售达340万美元。单季度毛利率达到68%,2021年同期只有29%。2022年全年总收入2744万美元,超出了2021年底预计的2400万美元,同比增长了149%,毛利率同比增长263%。
根据Telesis Bio预测,其2023年全年总收入将超过4500万美元,毛利率在55%—59%之间。近期,Telesis Bio将参与2023年欧洲抗体工程和治疗展,展示其用于简化抗体发现的全套分子生物学工作流程解决方案。

写在最后

作为CRO,Telesis Bio的路径并非难以复制——孵化于合成生物学先驱的母公司、机器技术研发团队来自于技术发明者本身、基础产品基础上不断延伸、发展出适应更多方向的套件装载品。
凭什么Telesis Bio能够脱颖而出,获得辉瑞合作协议,成为值得关注、后增动力强劲的基因领域CRO?更为重要的可能是步履不停——不断投入下一代技术研发、更新合成生物学应用场景、直面未来行业的激烈竞争。
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